MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK4

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010469	CAA	2	6	89	94	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016295
2	NC_010469	CTG	2	6	209	214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016295
3	NC_010469	GTGA	2	8	218	225	25 %	25 %	50 %	0 %	170016295
4	NC_010469	TGA	2	6	228	233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016295
5	NC_010469	AC	3	6	277	282	50 %	0 %	0 %	50 %	170016295
6	NC_010469	TTG	2	6	350	355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016295
7	NC_010469	TTA	2	6	479	484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016295
8	NC_010469	CA	3	6	502	507	50 %	0 %	0 %	50 %	170016295
9	NC_010469	ACA	2	6	555	560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016295
10	NC_010469	A	6	6	824	829	100 %	0 %	0 %	0 %	170016296
11	NC_010469	TA	3	6	884	889	50 %	50 %	0 %	0 %	170016296
12	NC_010469	TAA	2	6	906	911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016296
13	NC_010469	TCA	2	6	934	939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016296
14	NC_010469	TC	3	6	947	952	0 %	50 %	0 %	50 %	170016296
15	NC_010469	ACAAAA	2	12	963	974	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	170016296
16	NC_010469	GAT	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016296
17	NC_010469	ATT	2	6	1114	1119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016296
18	NC_010469	A	6	6	1129	1134	100 %	0 %	0 %	0 %	170016296
19	NC_010469	CAA	2	6	1156	1161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016296
20	NC_010469	CAA	2	6	1172	1177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016296
21	NC_010469	GAA	2	6	1232	1237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016296
22	NC_010469	A	6	6	1267	1272	100 %	0 %	0 %	0 %	170016296
23	NC_010469	T	7	7	1508	1514	0 %	100 %	0 %	0 %	170016297
24	NC_010469	T	7	7	1581	1587	0 %	100 %	0 %	0 %	170016297
25	NC_010469	T	7	7	1625	1631	0 %	100 %	0 %	0 %	170016297
26	NC_010469	GTAA	2	8	1647	1654	50 %	25 %	25 %	0 %	170016297
27	NC_010469	AGAT	2	8	1736	1743	50 %	25 %	25 %	0 %	170016297
28	NC_010469	TCA	2	6	1769	1774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016297
29	NC_010469	TGA	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016297
30	NC_010469	ACA	2	6	1940	1945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016297
31	NC_010469	TGATT	2	10	1995	2004	20 %	60 %	20 %	0 %	170016297
32	NC_010469	GAA	2	6	2832	2837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016298
33	NC_010469	T	6	6	2871	2876	0 %	100 %	0 %	0 %	170016298
34	NC_010469	ACC	2	6	2883	2888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016298
35	NC_010469	GTT	2	6	2985	2990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016298
36	NC_010469	TGA	2	6	2993	2998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016298
37	NC_010469	A	6	6	3000	3005	100 %	0 %	0 %	0 %	170016298
38	NC_010469	AAG	2	6	3028	3033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016298
39	NC_010469	A	6	6	3086	3091	100 %	0 %	0 %	0 %	170016298
40	NC_010469	TGC	2	6	3094	3099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016298
41	NC_010469	A	6	6	3162	3167	100 %	0 %	0 %	0 %	170016298
42	NC_010469	A	6	6	3191	3196	100 %	0 %	0 %	0 %	170016298
43	NC_010469	ACA	2	6	3217	3222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016298
44	NC_010469	GAA	2	6	3392	3397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016298
45	NC_010469	AAG	2	6	3478	3483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016298
46	NC_010469	AGC	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016298
47	NC_010469	CTG	2	6	3513	3518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016298
48	NC_010469	GAA	2	6	3648	3653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016298
49	NC_010469	A	6	6	3659	3664	100 %	0 %	0 %	0 %	170016298
50	NC_010469	TAGAT	2	10	3740	3749	40 %	40 %	20 %	0 %	170016298
51	NC_010469	ATTA	2	8	3773	3780	50 %	50 %	0 %	0 %	170016298
52	NC_010469	AC	3	6	4366	4371	50 %	0 %	0 %	50 %	170016299
53	NC_010469	GTC	2	6	4397	4402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016299
54	NC_010469	ATA	2	6	4407	4412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016299
55	NC_010469	CAA	2	6	4489	4494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016299
56	NC_010469	T	7	7	4543	4549	0 %	100 %	0 %	0 %	170016299
57	NC_010469	AATGAT	2	12	4556	4567	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170016299
58	NC_010469	A	6	6	4596	4601	100 %	0 %	0 %	0 %	170016299
59	NC_010469	T	7	7	4615	4621	0 %	100 %	0 %	0 %	170016299
60	NC_010469	A	6	6	4628	4633	100 %	0 %	0 %	0 %	170016299
61	NC_010469	TAAT	2	8	4746	4753	50 %	50 %	0 %	0 %	170016299
62	NC_010469	AAT	2	6	4760	4765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016299
63	NC_010469	AGTA	2	8	4805	4812	50 %	25 %	25 %	0 %	170016299
64	NC_010469	ATT	2	6	4817	4822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016299
65	NC_010469	GAC	2	6	4881	4886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016299
66	NC_010469	GAA	2	6	4889	4894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016299
67	NC_010469	A	6	6	5063	5068	100 %	0 %	0 %	0 %	170016299
68	NC_010469	GCA	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016299
69	NC_010469	A	7	7	5105	5111	100 %	0 %	0 %	0 %	170016299
70	NC_010469	GAT	2	6	5120	5125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016299
71	NC_010469	GAT	2	6	5141	5146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016299
72	NC_010469	GATAA	2	10	5162	5171	60 %	20 %	20 %	0 %	170016299
73	NC_010469	AAG	2	6	5175	5180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016299
74	NC_010469	TTG	2	6	5249	5254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016299
75	NC_010469	AT	3	6	5257	5262	50 %	50 %	0 %	0 %	170016299
76	NC_010469	AT	3	6	5371	5376	50 %	50 %	0 %	0 %	170016299
77	NC_010469	A	6	6	5426	5431	100 %	0 %	0 %	0 %	170016299
78	NC_010469	GAG	2	6	5514	5519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170016300
79	NC_010469	CAATA	2	10	5539	5548	60 %	20 %	0 %	20 %	170016300
80	NC_010469	ACAA	2	8	5565	5572	75 %	0 %	0 %	25 %	170016300
81	NC_010469	CAAA	2	8	5580	5587	75 %	0 %	0 %	25 %	170016300
82	NC_010469	GTT	2	6	5601	5606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016300
83	NC_010469	ACAA	2	8	5655	5662	75 %	0 %	0 %	25 %	170016300
84	NC_010469	ACAA	2	8	5689	5696	75 %	0 %	0 %	25 %	170016300
85	NC_010469	TGA	2	6	5747	5752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016300
86	NC_010469	CAA	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016300
87	NC_010469	A	6	6	5874	5879	100 %	0 %	0 %	0 %	170016300
88	NC_010469	GAA	2	6	5886	5891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016300
89	NC_010469	ATG	3	9	5938	5946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016300
90	NC_010469	AAG	2	6	5953	5958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016300
91	NC_010469	ACAA	2	8	5968	5975	75 %	0 %	0 %	25 %	170016300
92	NC_010469	AACCTA	2	12	6007	6018	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	170016300
93	NC_010469	GTG	2	6	6023	6028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016300
94	NC_010469	A	6	6	6170	6175	100 %	0 %	0 %	0 %	170016301
95	NC_010469	TTG	2	6	6192	6197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016301
96	NC_010469	A	6	6	6308	6313	100 %	0 %	0 %	0 %	170016301
97	NC_010469	GAA	2	6	6365	6370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016301
98	NC_010469	TAG	2	6	6596	6601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016302
99	NC_010469	ATC	2	6	6679	6684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016302
100	NC_010469	GAAA	2	8	6693	6700	75 %	0 %	25 %	0 %	170016302
101	NC_010469	A	6	6	6698	6703	100 %	0 %	0 %	0 %	170016302
102	NC_010469	ATTT	2	8	6789	6796	25 %	75 %	0 %	0 %	170016302
103	NC_010469	TAC	2	6	6798	6803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016302
104	NC_010469	AGAA	2	8	6815	6822	75 %	0 %	25 %	0 %	170016302
105	NC_010469	GTA	2	6	6883	6888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016302
106	NC_010469	GAT	2	6	6922	6927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016302
107	NC_010469	AGA	2	6	6939	6944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016302
108	NC_010469	A	7	7	6958	6964	100 %	0 %	0 %	0 %	170016302
109	NC_010469	AGA	2	6	6975	6980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016302
110	NC_010469	CAT	3	9	7024	7032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016302
111	NC_010469	TGC	2	6	7164	7169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016303
112	NC_010469	ACTA	2	8	7180	7187	50 %	25 %	0 %	25 %	170016303
113	NC_010469	AACA	2	8	7354	7361	75 %	0 %	0 %	25 %	170016304
114	NC_010469	TCA	2	6	7377	7382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016304
115	NC_010469	GGA	2	6	7570	7575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170016304
116	NC_010469	ATG	2	6	7579	7584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016304
117	NC_010469	TCT	2	6	7724	7729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016304
118	NC_010469	T	7	7	7746	7752	0 %	100 %	0 %	0 %	170016304
119	NC_010469	AGCC	2	8	7784	7791	25 %	0 %	25 %	50 %	170016304
120	NC_010469	ATG	3	9	7792	7800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016304
121	NC_010469	A	6	6	7999	8004	100 %	0 %	0 %	0 %	170016304
122	NC_010469	GAAA	2	8	8070	8077	75 %	0 %	25 %	0 %	170016304
123	NC_010469	CGTT	2	8	8117	8124	0 %	50 %	25 %	25 %	170016304
124	NC_010469	A	7	7	8164	8170	100 %	0 %	0 %	0 %	170016304
125	NC_010469	TGG	2	6	8187	8192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016304
126	NC_010469	TCAA	2	8	8198	8205	50 %	25 %	0 %	25 %	170016304
127	NC_010469	AACC	2	8	8206	8213	50 %	0 %	0 %	50 %	170016304
128	NC_010469	TCAA	2	8	8255	8262	50 %	25 %	0 %	25 %	170016304
129	NC_010469	TGC	2	6	8346	8351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016304
130	NC_010469	TCT	2	6	8366	8371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016304
131	NC_010469	T	6	6	8378	8383	0 %	100 %	0 %	0 %	170016304
132	NC_010469	CTT	3	9	8413	8421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016304
133	NC_010469	TTG	2	6	8477	8482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016304
134	NC_010469	TTA	2	6	8518	8523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016304
135	NC_010469	CAGAA	2	10	8527	8536	60 %	0 %	20 %	20 %	170016304
136	NC_010469	A	6	6	8546	8551	100 %	0 %	0 %	0 %	170016304
137	NC_010469	TTA	2	6	8624	8629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016304
138	NC_010469	TGA	2	6	8637	8642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016304
139	NC_010469	GCA	2	6	8665	8670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016304
140	NC_010469	GAAG	2	8	8674	8681	50 %	0 %	50 %	0 %	170016304
141	NC_010469	TCAA	2	8	8700	8707	50 %	25 %	0 %	25 %	170016304
142	NC_010469	GCT	2	6	8716	8721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016304
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162	NC_010469	TCTAA	2	10	9785	9794	40 %	40 %	0 %	20 %	170016305
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191	NC_010469	ACCA	2	8	11881	11888	50 %	0 %	0 %	50 %	170016307
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.